Notes

Outline

Workshop Systeembiologie onder auspiciën van NWO-ALW Utrecht, 4 november 2002

programma 1. inleiding 2. kadering van het wetenschapsveld Systeembiologie 3. contouren van een Nederlands initiatief 4. oprichting van een Nederlands platform Systeembiologie 5. deelname aan EU-KP6 en andere (inter)nationale programma’s 6. afsluiting: samenvatting en actieplan

inleiding aspecten van Systeembiologie grote nationale en internationale samenwerkingsverbanden ‘big science’: grote investeringen Nederland heeft potentie belangrijke internationale rol te spelen integrerende functie van Systeembiologie omics programma’s, bioinformatica

inleiding doel van workshop creëren van een Nederlands platform voor Systeembiologie open voor alle Nederlandse onderzoekers in SB veld sterke deelname aan EU-KP6: Nederlandse initiatieven coordinatie met andere onderzoeksprogramma’s in Nederland ontwikkelen van wetenschapsveld

System Biology-NL Opening/Inleiding Kadering wetenschapsveld Contouren NL initiatief NL platform SB Deelname EU-FP6 en andere internationale programma’s Afsluiting: samenvatting en actieplan

Kadering wetenschapsgebied Waarom nu? Wat gebeurt er internationaal? SB (o.a.) is BIG SCIENCE Wat is systeem biologie? Relatie met genomics Urgentie DISCUSSIEPUNTEN: Wat is SB? Wie doet er al wat aan? Wat is SB meer dan Genomics?

February 15, 2001

Does DNA alone explain life?

If not in DNA sequence alone … and if there is a lot more  to be understood … then ….. Where is it? What is it?

Life arises not just in the isolated molecules but in their communication

Metabolic network: Small molecules (·) interconverted by enzymes (-) How do they produce function ? By communicating

Now that we ‘know’ the molecules: The challenge of the 21st century Understand the living cell On the basis of the molecules and their dynamic interactions

Systeem Biologie: levende cel in situ en in silico

Kadering wetenschapsgebied Waarom nu? Wat gebeurt er internationaal? SB (o.a.) is BIG SCIENCE Wat is systeem biologie? Relatie met genomics Urgentie DISCUSSIEPUNTEN: Wat is SB? Wie doet er al wat aan? Wat is SB meer dan Genomics?

Wat gebeurt er internationaal? Leroy Hood: ISB (Seattle) Al Gilman Alliance Cell Signalling E-cell Virtual cell ICSB2001, 2002, 2004 Duitse levercel SB (M$ 50) Model alliance E. coli (Science August) EU: FP6

Wat is systeem biology? Leroy Hood Duitse levercel SB ICSB Erato Kitano Nature Science ESBIGH

Wat is systeem biology? Breed en open houden Maar niet alles: Van moleculen naar organisme (en terug) Kwantitatief (modelleerbaar) experimenteel onderzoek Modelleren, maar dan betrokken op de enige experimentele werkelijkheid Niet alleen analyse, ook begrijpen

Relatie met genomics

Urgentie NL had voorsprong Japan, VS, Duitsland, Zweden, Finland zetten groots in Folstar initiatief vergeet Systeembiologie Human capital moet gekweekt worden/lag fase

Kadering Systeembiologie DISCUSSIEPUNTEN: Wat is SB? Wie doet er al wat aan? Wat is SB meer dan Genomics? …?

System Biology-NL Opening/Inleiding Kadering wetenschapsveld Contouren NL initiatief NL platform SB Deelname EU-FP6 en andere internationale programma’s Afsluiting: samenvatting en actieplan

Contouren NL initiatief BIG SCIENCE gelegenheden: Netherlands Genomics Strategy, ICES-KIS, FOM FP6: ESBIGH ICSB 2004: Europees Voorbeeld NL profilering: www.siliconcell.net DISCUSSIEPUNTEN

Contouren NL initiatief DISCUSSIEPUNTEN: Willen we aansluiten op BIG SCIENCE? Willen we ESBIGH/FP6 coordineren? Kunnen we zeggen dat we nu al SB doen? Kunnen we bestaande projecten betere op elkaar aan laten sluiten en daar dan fondsen voor vragen (FP6 bv)? Willen we speerpunten (bv Silicon cell…)? ….?

System Biology-NL Opening/Inleiding Kadering wetenschapsveld Contouren NL initiatief NL platform SB Deelname EU-FP6 en andere internationale programma’s Afsluiting: samenvatting en actieplan

platform Systeembiologie doel nationaal aanspreekpunt nemen van initiatieven op terrein van Systeembiologie afstemming met internationale programma’s urgent: EU-KP6 verbindingen met andere NL programma’s NWO en Regieorgaan betrekken van industrie ontwikkelen van wetenschapsveld wetenschappelijke bijeenkomsten leerstoelen onderwijs verder...?

platform Systeembiologie voorstel voorstel instellen NWO commissie Systeembiologie eerste aktiviteiten deelname EU-FP6 wetenschappelijke bijeenkomsten eerste bijeenkomst januari...? overleg NWO en Regieorgaan verder...?

System Biology-NL Opening/Inleiding Kadering wetenschapsveld Contouren NL initiatief NL platform SB Deelname EU-FP6 en andere internationale programma’s Afsluiting: samenvatting en actieplan

Deelname EU-FP6 en andere internationale programma’s Nodig: presentatie als groot lopend programma voor FP6 synergisme subsidie Coordinatie van Europese SB (Met Duitsland, Oostenrijk, Zweden, … ) Vormen van internationale consortia (Wanner, Leroy Hood, VBI, Duitse hepatocyt SB) DISCUSSIE: Willen we inderdaad als NL-SB meedoen? Willen we consortia vormen?

System Biology-NL Opening/Inleiding Kadering wetenschapsveld Contouren NL initiatief NL platform SB Deelname EU-FP6 en andere internationale programma’s Afsluiting: samenvatting en actieplan

afsluiting samenvatting en actieplan Actiepunten www.systembiology.net